176年前, 江戶時代後期・嘉永元年（西元1847年）之時, 開始建築現有的本殿。 參與共事的都是鳥取藩裡優秀的木匠們。
當時, 統治鳥取的池田藩的第一代藩主池田光仲是徳川家康的曾孫。 說起徳川家康, 想到的就是栃木縣日光市的日光東照宮。 以把家康神化的「東照大権現」做為主祭神奉養而著名。
在日光東照宮的社殿可以看到「非禮勿視　非禮勿聽　非禮勿言」的三隻猴子及睡貓等各式各樣動物的木雕。 與德川家族有深厚關係的鳥取池田藩於是特地命令原本不是神社木匠的師傅們去學習, 並且建造了日光東照宮的分院鳥取東照宮, 之後又建造了神﨑神社。
木匠們開始建造本殿, 把在鳥取城下細心加工的木材從賀露港運到菊港, 在神﨑神社進行組裝。
直到本殿建造完成, 總共花了6年的歳月。
本殿是以「一間社入母屋」的建造法所建, 所有的建築素材都是櫸木。
本殿除了刻有植物、動物之外, 還有大黑神(財神)、惠比壽神等精心雕刻的吉祥木雕。

本殿竣工26年後, 開始著手建造前殿。 繼承這一項重要工作的, 竟然是當初建造本殿的木匠們的孫子們! 經過了漫長的歲月, 在一個新的時代裡, 前殿的誕生得以實現。

孫子們在建造前殿的時候, 決定要製作最適合御祭神素戔嗚尊的木雕, 於是他們把焦點放在跟海有關的三個主題, 刻了精緻的木雕作品。

於前殿正面的大注連繩上方的海龍宮、乙姫公主、浦島太郎等木雕, 刻得栩栩如生, 宛如從童話中跳出來一般地精緻。 此外, 朝著前殿入口的右邊、刻著的是日本第14代天皇・仲哀天皇的皇后「神功皇后」。 她在前往對抗大和王權的熊襲地區的途中遭遇了仲哀天皇的駕崩, 並繼承了他的意志, 完成了熊襲征伐的志願。 當時神功皇后身懷六甲過海入侵新羅, 征服了百濟和高麗的英勇姿態也被刻在那裏。

朝著前殿入口的左邊, 刻著的是「武内宿禰」。 武内宿祢侍奉仲哀天皇, 繼承了他的遺願,繼續支撐著神功皇后。 天皇駕崩, 皇后出征, 武內宿弥在面對如此困難的情況之下, 聽從了住在住吉大社的海神們的建議, 決定好好地扶養神功皇后肚子裡的孩子。 遵守著這個約定, 武内宿祢果然平安地把孩子扶養長大, 那孩子在那之後也成了第15代應神天皇。 他以身為一個很能打仗的神「品陀別命」之名, 成為全國的八幡神社所崇敬的存在。
前殿的入口刻著的是武内宿祢緊緊地抱住幼兒時期的應神天皇, 把他的熱情與奉獻的精神都蘊含在這個木雕當中了。